建立科学的支付标准是医保支付制度变革的关键环节。按照什么样的价格标准支付，按照什么样的数量标准支付，按照什么样的质量标准支付，构成了医保支付标准体系的基本内容。应当以“平均先进”为原则，确定各类支付项目的价格标准，包括药品的价格支付标准、诊疗项目的价格支付标准和服务项目的价格支付标准。各类支付项目（包括药品、诊疗、服务等项目）的数量单位、数量算法、质量要求、医疗行为规范性等要统一规定，使不同地区、不同医疗机构之间在服务数量、服务质量和服务规范等方面具有可比性，并据此测算出不同医疗机构提供的医疗服务价值的高低以及应补偿的医保基金数额的大小（按价值论价格，奖优罚劣）。通过以上变革，有利于实现“由经验付费向科学付费”跨越，有利于形成“优良优价”的良性支付机制。医保控费不是简单地控制医疗费用的过快增长，而是将有限的医保基金用到刀刃上。医保内控软件基本功能
医保控费为什么需要尽快落实？支付方式不合理，医疗保险支付一般可分为提前支付和以后支付两种，前者指按服务项目付费，后者有总额预算、按人头付费、按病种付费等方式。目前我国应用普遍的总额预算在医院的服务超越预算成本时，医保机构将不再支付超出的费用，这部分费用算作医院的损失，这种支付方式的优点是使医保机构能够有效控制医疗费用。同时在一定程度上能督促医院提高服务质量，但同时也会带来一定的负面影响，即医院会根据医保机构的支付情况来调整服务的供给，从实际效果来看，此种付费方式的实施结果也不尽如人意。医保内控软件基本功能建立科学的支付标准是医保支付制度变革的关键环节。
医保控费信息化的发展是符合客观发展规律的。首先，医保支付占比的提高，带来医保系统内部的变化。随着我国医保支付比例的提高，首先带来的就是医保基金的支付压力逐步加大。从各地医保基金的运行情况看，每年尚有结余，但医保基金的支出是刚性的增长，医保基金覆盖率总会达到某个极限，基金收入水平又受到当地经济发展水平的限制，各地医保基金收支压力在未来几年不容小觑；另外就是管理方式存在变革的需要。各地医保中心配置不过十几人，在医保支付占比较小的时期，尚可以应付稽查的需要，但随着医保支付占比逐步提高，原有的管理方式已经不能适应医保控费的发展形势。
医保支付制度变革的目标是：控制医疗资源浪费造成的医疗费用的过快增长，管好用好有限的医保基金，确保患者的医疗费用得到有效补偿。因此，医保支付制度变革的目标不是盲目地控制医保基金的合理支出，也不是简单地控制医疗费用的适度增长，而是把有限的医保基金用到刀刃上，不断提高医保基金使用效率，增强医保基金的抗风险能力，使患者得到更充分的医疗保障。医保支付制度应当如何变革呢？医保基金多了就多支付，医保基金少了就少支付，医保基金出现了缺口就不支付吗？显然不是。研究认为，医保支付制度应遵循“按需支付、量能支付、按价值支付”的变革原则。“按需支付”是相对参保患者而言的，“量能支付”是相对医保基金而言的，“按价值支付”是针对医疗机构而言的。医保控费系统：精细化和市场化是主旋律。
医疗信息化不断提升，从外部准备条件。在医保体制逐步建立的同时，医疗信息化的建设也是如火如荼的发展，以各地医院HIS为主的医疗信息化水平已经很高，各方面的底层数据已经比较完备，这就为医保控费的信息化准备良好的客观条件；我国医疗体制“委托-代理”关系的从无到有，从小到大，各地医保中心与医院的关系逐步理顺，具备我国特色的医疗系统第三方支付体制已经确立。医保控费信息化的建设具备承上启下的重要意义。我国下一步医疗卫生变革的方向就是医疗、医药、医保“三医联动”的方式，而其中“医保”是撬动整体医疗体制变革的杠杆。我国下一步医疗卫生变革的方向就是医疗、医药、医保“三医联动”的方式。中小医院医保内控系统组成部位
医保控费系统功能包括超标提醒。医保内控软件基本功能
医保控费，简言之，就是控制不合理的医疗费用。我国存在看病难,看病贵的普遍现象，国家的医保资金面临亏空，一些不合理用药、滥用药等行为导致医保费用浪费。医保控费就是要减少不合理支出，提高医保基金使用率。 目前针对医保控费主要政策有三，一是医院控制药占比，二是医院医保费用限额拨付，三是按病种付费。点对诊疗过程中出现过度诊疗、过度检查、分解治方、超量开药、重复开药，不得重复收费、超标准收费、分解项目收费等操作进行监管和预警。医保内控软件基本功能
