1、微生物菌剂施用时间一般为清晨或者阴天。微生物菌剂中的芽孢杆菌不能在阳光下直射，会使其繁殖、代谢等活动受到影响，甚至会是去活性，一定要避免在炎热高温的天气使用。2、微生物菌剂对土壤条件要求比较严格，像土壤水分含量、有机质含量、以及pH值的大小都会影响其作用的发挥。一般菌适宜生存在含水量60%-70%的土壤中，所以施用后应立即浇透水，菌肥和有机肥混合施用，可以明显提高土壤中有机质的含量。3、微生物菌剂不应该长期放置，应该随用随买；使用前应该存放阴凉干燥、通风处，避免受热、受潮以及阳光直射；肥料开口后应一次用完，否则会导致其他菌进入，污染肥料中的菌。4、微生物菌剂不要与能够杀死有益菌的物质一同使用，菌剂因为里边含有大量的有益活菌，所以严禁与杀菌剂、杀虫剂、除草剂和含硫的化肥(如硫酸钾等)以及稻草灰混合用。因为这些农药或者肥料中的物质会很容易造成菌的失活，导致其失去效果。如果要施用的话，应**少间隔48小时后再用。5、微生物菌剂不能随意混合化肥施用。虽然菌可以与化肥、有机肥等混合施用，但是这并不意味着可以随意混合。当化肥中氮磷钾等元素的总含量超过7%时就会在很大程度上***菌的活性。生物菌肥其在我国已有近50年的历史，从根瘤菌剂——细菌肥料——微生物肥料.海南低价生物菌肥技术指导
适量施用土壤中施入较多的菌肥，虽然不会出现烧根烧苗现象，但也并不是施得越多就越好。盲目大量施用生物菌肥，虽然不会向化学肥料那样造成蔬菜烧根死苗，只是蔬菜植株体内盐类积累增加，有害消费者的圣体健康，恶化土壤质地，但起码增加了肥料投入成本（因为生物菌肥价格较高），降低蔬菜的栽培效益。因此，应根据不同作物的需要和土壤养分状况，科学地确定生物菌肥施肥量，才能达到增产增收的目的。在土壤状况比较正常的情况下，一般以亩（667平方米）施用生物菌肥80公斤左右为宜。如果土壤盐渍化程度较高，可适当增加生物菌肥的施用量。一般根据土壤的盐渍化程度高低，每亩（667平方米）可适当增施10～20公斤为宜。北京常规生物菌肥市场报价生物菌肥中的菌种能够与作物根系共生，增加根系表面积，提高养分吸收效率，从而显著提高作物的产量和品质。
生物菌肥主要作用：提高土壤肥力：有些菌剂可以增加土壤中氮磷钾营养元素的含量；还可以提高一些土壤酶类活性，有利于土壤中养分的转化方便植物的吸收利用。促进难溶的矿质营养释放：生物菌肥使土壤酶活性提高，使不溶性土壤养分溶解利于植物吸收。同时，还分泌一些有机酸性物质，能分解有机质，产生的糖有利于固氮细菌的生长。帮助农作物吸收养分：如根瘤菌可刺激豆科植物的根部形成根瘤，使土壤中的氮转化为作物能吸收的氮肥。增强植物抗病(虫)能力：生物菌肥中的微生物在土壤中能分泌***、杀虫剂及植物生长***。***及杀虫剂能杀灭植物病害及害虫的虫卵，植物生长***促进叶绿素含量升高，提高植物光合作用的能力。增强植物的抗逆能力：有些生物菌肥施用后，在土壤中大量生长繁殖，聚集在作物根部形成优势菌群，在其自身生长过程的同时，改善周围的环境，提高植物体的抗逆性。提高作物品质：菌群中的侧孢芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌等可降低植物体内硝酸盐含量20%以上，能降低重金属含量，可使果实中Vc含量提高30%以上，可溶性糖提高2~4度。
温度在微生物肥料中的作用这里就主要说温度与生物菌活性的影响。首先就结论上来说：生物菌的活性会随着温度降低而降低，但是生物菌不会被冻死，只会休眠。但不是说活性会随着温度降低而降低吗？怎么当前还更适合施用菌肥呢？别急，之所以有这些疑惑，是因为混淆了气温与地温的关系。1、气温我们平常所说的温度，无论是天气热了，还是天气凉了，其实一般都是指的是气温。而气温的测量是在离地1.5米，避免阳光直射、通风的草坪上，这样能更真实体现大气的温度状况。但是我们的菌肥是用在土壤当中的，所以气温的变化不能用来作为衡量生物菌活性的标准，为此我们需要的是地温的衡量。微生物在土壤中物质和能量的输入输出中扮演着非常重要的角色，是物质循环链上的重要环节。
有数据显示，我们畜牧业排泄物总量居世界***，目前这些排泄物还田率很低，排入环境，造成了巨大污染，且多数未经腐熟无害化处理，不仅吸收利用效果差，还带入土壤很多病菌虫卵，导致更多病虫害。这亟需进行菌肥有机肥的转化利用；此外，我国农业废弃物数以亿计，这也是微生肥菌肥的宝贵资源。如果利用起来，加工成菌肥施入土壤后可以将贫瘠的土壤改造为肥沃的良田。这样种出的农作物健康、好吃、产量高、多卖钱！据统计，目前我国微生物肥料生产企业总数有1100多家，遍布除西藏外的30个省（区、市），年产量1200万吨，年产总值达200亿元，生物肥料累积应用面积2亿亩以上。市场上出现的各种生物肥料，实际上是含有大量微生物的培养物。它们可以是粉剂或颗粒，也可以是液体状态。贵州大丰收生物菌肥市场报价
《农用微生物菌剂GB 20287-2006》是没有有机质、氮磷钾的要求。但是菌含量、杂菌率等质量要求。海南低价生物菌肥技术指导
满足生物菌肥肥效发挥条件。有机生物菌肥内含有大量的土壤微生物菌剂，这些微生物能够释放土壤中的不可溶性磷钾等肥料元素，施用后增效显着。但是，这类微生物多是好气性菌类，它们的一切生命活动，都需要适宜的温度、水分和适量的氧气。因此，必须在高温焖室以后才能施用，以免焖室时因土温高，使之失去活力，而且要浅施，入土深度5～8厘米为好，不可深于10厘米，防止深层土壤氧气不足，影响微生物的活性，降低使用效果。施用菌肥要注意田间实际状况。对含硫高的土壤和锈水田，不宜施用生物菌肥，因为硫能杀死生物菌。对于翻浆的水田，一般不用撒肥，可采用喷雾的方法，效果更明显。海南低价生物菌肥技术指导
