蛋白酶用于生成肽,用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影,传统的蛋白酶并不总是理想的,因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶,可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比,所得肽更长,并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物,使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性,即使在长时间孵育过夜后,酶与底物的比例也很高(1:5)。然而,ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性,但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1:20 和过夜孵育下,证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下,GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性,并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。GingisREX与胰蛋白酶消化相比,可生成更长的肽。浙江IdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
与IdeS不同,Genovis的GingisKHAN(Kgp)是一种半胱氨酸蛋白酶,可在铰链上方的单个位点(KSCDK/THTCPPC)消化人IgG1,产生完整且均质的Fab和Fc片段。GingisKHAN是一种赖氨酸特异性蛋白酶。单一的消化位点是人IgG1三维结构的结果,使这种赖氨酸暴露于酶中。如果去除N-聚糖,则Fc上暴露的赖氨酸处可能会出现额外的消化位点。GingisKHAN需要温和的还原条件才能具有活性,并且在37°C和pH8下获得活性。还原剂(2mM半胱氨酸)与酶一起提供。GingisKHAN是从牙龈卟啉单胞菌中纯化的。该酶用于使用LC-MS表征基于抗体的生物zhiliao药物,研究Fc聚糖分析、双特异性抗体、亲和力和亲和力效应,并鉴定翻译后修饰。IdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶IgASAP酶是独特的酶促工具,可实现 IgA 的中级表征和质量控制,用于疫苗诊断的开发过程。
Genovis的FabRICATOR(IdeS)是一种独特的酶,可在铰链区域下方的特定位点消化IgG,产生均匀的F(ab')2和Fc/2片段。除IgG外,没有其他底物是已知的。IgG在30分钟内消化,如果孵育时间延长,则不存在过度消化的风险。由于FabRICATOR在生理反应条件下消化IgG,因此保留了免疫反应性。在37°C下获得良好的活性,但也可以在室温下使用较长的反应时间进行消解。FabRICATOR可消化人类的所有亚类以及猴子、兔子和绵羊IgG的某些亚类。它对小鼠IgG2a和IgG3的活性有限-为了消化这些抗体物种,我们建议使用FabRICATORZ。FabRICATOR是从化脓性链球菌克隆而来的,并在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为37725Da。FabRICATOR是IdeS的重组修饰形式,由GenovisAB开发,用于需要高标准和一致性的生物技术应用。有一种检测FabRICATOR酶的方法。了解有关山羊多克隆抗体Anti-FabRICATOR的更多信息。
对于涉及完整Fab或Fc抗体片段的应用,需要在抗体铰链处进行消化。木瓜蛋白酶和 Lys-C 等传统酶可用于生成 Fab 片段,但非特异性酶活性需要仔细优化,以极大限度地降低多个消化位点的风险。Genovis的SmartEnzymes IgG 蛋白酶 GingisKHAN 和 FabALACTICA 具有一个消化位点,可从人 IgG1 生成均质的 Fab 和 Fc 抗体片段。生成的片段可用于结晶和高阶结构 (HOS) 的 NMR 研究、结合研究等。在这里,我们提出了获得完整Fab和Fc抗体片段的不同策略。所得片段显示 GingisKHAN 的有效消化,用于生成完整的 Fab 片段或从依那西普上的融合 TNFR 结构域中分离 Fc。由于 GingisKHAN 的特异性消化依赖于 IgG 的天然折叠,因此在变性条件下特异性受到负面影响。为了使用SDS-PAGE分析消解效率,在加入SDS上样缓冲液之前,停止在分析样品中加入碘乙酰胺的反应。Genovis同时提供IdeS酶的纯化试剂盒。Genovis酶的适应于克隆筛选,工艺开发和验证以及稳定性研究,也适用于受控环境中的批次放行方法。
与IdeS不同,Genovis的GingisREX(RgpB)是一种精氨酸特异性蛋白酶,可消化精氨酸残基的C末端蛋白质,包括难以与其他酶消化的Arg-Pro键。该酶可用于肽图分析、从头肽测序和翻译后修饰分析。精氨酸残基的特异性C-末端消化;在其他困难的精氨酸-脯氨酸序列中可靠消化;产生更长的肽-提高序列覆盖率。GingisREX是一种半胱氨酸蛋白酶,可特异性地消化肽键C末端到精氨酸残基,包括与脯氨酸相连的精氨酸。半胱氨酸是酶活性所必需的。与胰蛋白酶消化相比,可生成更长的肽,胰蛋白酶消化可以通过高分辨率质谱进行分离和鉴定。这为自下而上方法的样品制备提供了更多选择,以实现替代的酶解曲线和更高的序列覆盖率。GingisREX在赖氨酸上没有活性,通常使用Arg-C观察到。该酶在5.0-9.0的宽pH值范围内具有活性,它需要半胱氨酸并被盐酸胍抑制。该酶是从牙龈卟啉单胞菌中纯化的。Genovis的FabDELLO作用于人 IgG1 铰链上方的单个暴露赖氨酸残基。江西FabRICATOR ZIdeS蛋白酶蛋白组学
这就是为什么Fc/2和GLP-1肽都被检测为几种变体。浙江IdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
Genovis酶的适应性和更高的通量和自动化工作流程的中级方法,这是非常重要的。 随着分析方法和仪器的改进,在表征实验室中有更大的能力进行更多类型的分析,或者在工艺开发或QC实验室中有更先进的分析仪器。 当涉及到能够支持大量样本分析的活动时,例如克隆筛选,工艺开发和验证以及稳定性研究,这是非常好的。 此外,Genovis产品的效率、健壮性(Robust)和易用性使它们更容易应用于这些类型的工作,而且,也适用于受控环境中的批次放行方法。Genovis的产品很好地支持这种类型的工作,这也促使Genovis不断推出新产品和现有产品的不同形式,以支持客户的工作。浙江IdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
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