大规模生产阶段，AAV/LV载体生产流程跟抗体、疫苗类药物的生产类似，主要包含上游培养、下游纯化及制剂部分。上游培养分为质粒开发、细胞扩增、三质粒共转染及病毒载体生产等步骤。下游纯化分为细胞裂解释放AAV病毒颗粒（可以通过去污剂、机械作用、高渗或冻融操作等）or收获细胞上清液得到含LV病毒原液、加入核酸酶以减少宿主细胞核酸污染、澄清是通过离心或过滤等方法去除细胞碎片和杂质等、超滤浓缩以减少后续色谱纯化体系、亲合及离子交换等纯化得到高纯度病毒载体。制剂部分主要是超滤更换缓冲液、过滤除菌及制剂灌装等。在生物制品生产，如AAV载体及腺病毒载体疫苗生产中，宿主细胞DNA残留是关键质量参数之一。江西500mM盐浓度条件高盐核酸酶70921
跟其他类型的核酸酶一样，SAN HQ高盐核酸酶和M-SAN HQ中盐核酸酶的灭活方法有很多，分为可逆灭活及不可逆灭活。金属离子螯合剂如EDTA会可逆抑制两者的活性，加入的EDTA浓度一般是溶液中Mg2+浓度的2倍左右即可完全抑制活性；后续补加过量的Mg2+即可恢复核酸酶活性。加热、还原剂（如DTT）、咪唑、甘油及表面活性剂（如高于15%浓度的Triton X-100、SDS、尿素等）等都可以使其不可逆失活。在生物工艺流程，需要结合上下游应用需要选择合适的方法去除或灭活核酸酶。山西高盐核酸酶70921-160鉴于其在高盐条件下的较高活性，SAN HQ高盐核酸酶在不损失载体产量和活性的情况下改善了下游工艺。
氯化铯(CsCl)/碘克沙醇密度梯度离心大概是经典的AAV纯化技术了。这种技术适用于所有血清型且分辨率高，但是因生产工艺很难放大，低通量等缺点阻碍了其在工业中的应用。继密度梯度离心之后，色谱法不断发展，并逐渐成为一种成熟的、主流的方法。色谱法通过载体的净电荷、疏水性、对配体的亲和性、大小以及其他性质来分离并纯化载体。这类技术有诸多的优点：更具可扩展性和成本效益，可多次重复使用，可并行运行或串联运行，还可有效去除非定植剂，这是开发后期的一个关键方面。
ArcticZymes厂家对盐活性核酸酶系列产品（Salt Active Nucleases，SANs）的生产及质控，包括SAN HQ高盐核酸酶和M-SAN HQ中盐核酸酶，在符合ISO13485:2016体系基础上，增加了cGMP质控标准，如microbes、endotoxin、蛋白酶等；同时提供TSE/BSE声明、无动物源（Animal-Origin Free）声明、非转基因声明等文件协助药物申报。此外，ArcticZymes的生产场地接受客户的定期审计，其第三方审计文件已得到国际TOP CDMO及Biotech的认可，并已经成为国际TOP CDMO的供应商。具体文件体系可以跟厂家或对应销售人员联系。SAN HQ高盐核酸酶促进残留DNA的消化，有助于符合FDA要求。
残留的宿主DNA是生产中产生的杂质，其存在潜在的致瘤性、传染性和免疫原性等风险。相关研究表明，基因的大小普遍在200bp以上，因此大于200bp有可能会有一定的致病性，而且残留DNA片段越大，生物制品的风险等级越高。因此，各国监管机构对其提出了严格要求。美国食品药品监督管理局（FDA）在《关于人类基因zhiliao新产品生产指导文件》中明确指出HCD的片段要小于200bp。2022年5月，国家药品监督管理局药品评审中心（CDE）发布的《体内基因药物产品药学研究与评价技术指导原则（试行）》中也明确指出需对DNA残留量和残留片段大小进行控制，建议尽量将DNA残留片段的大小控制在200bp以下。SAN HQ GMP是全球shou款市售GMP级别高盐核酸酶，于2023年Q4上市。江苏进口生物试剂高盐核酸酶70921-150
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在生物工艺中，核酸酶的主要作用是高效消化宿主细胞DNA（HCD），并将其分解成足够小的片段，以便在下游纯化过程中去除。虽然大多数核酸酶可以在生理盐条件下高效地将裸DNA降解成微小片段，比如Benzonase和SANs都可以把dsDNA分解成小于8nt的寡核苷酸链，但实际生产中的核酸污染情况更加复杂。HCD通常以染色质形式存在，与细胞裂解碎片、病毒颗粒等结合在一起，影响核酸酶的识别及剪切。因此，HCD去除的关键在于——核酸酶如何在复杂的生产体系中识别并剪切HCD。江西500mM盐浓度条件高盐核酸酶70921
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