蛋白酶用于生成肽，用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影，传统的蛋白酶并不总是理想的，因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶，可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比，所得肽更长，并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物，使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性，即使在长时间孵育过夜后，酶与底物的比例也很高（1：5）。然而，ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性，但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1：20 和过夜孵育下，证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下，GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性，并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。FabRICATOR Magic自动平行抗体酶切和亚基生成,用于处理与克隆选择。湖北FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学
与IdeS不同，在蛋白质zhiliao药物的质量控制过程中，详细分析和识别质量属性非常重要。对于具有柔性连接子的融合蛋白疗法，这包括确认连接蛋白的质量以及蛋白质接头的质量。使用 Genovis的GlySERIAS 的连接子酶切可以通过分离连接的蛋白质结构域来帮助这种质量控制。然而，连接子中的大量甘氨酸残基提供了酶的许多潜在消化位点，导致连接子内多个位点同时水解。消化的产物通常由连接蛋白的几种变体组成，并保留不同程度的连接子。虽然观察到的异质性通常不会对蛋白质亚基的详细表征产生负面影响，但有助于直接表征连接子，但有时需要更均匀的消化产物来详细分析单个蛋白质结构域。湖北FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学IdeS蛋白酶普遍适用于常见类型抗体，由于分析的简单性，中级方法非常适合自动化和高通量的工作流程。
Genovis的半胱氨酸蛋白酶 FabALACTICA （IgdE）与IdeS酶一样是特异性蛋白酶。在二维核磁共振波谱 （2D-NMR） 之后，可以通过 HOS 分析在精确的原子水平上评估 mAb 的关键质量属性。从Genovis的FabALACTICA Immobilized获得均相Fab和Fc片段的工作流程，是评估嵌合单克隆抗体英夫利昔单抗中HOS的理想选择，在海报“FabALACTICA产生纯和均相的mAb亚基，促进2D-NMR波谱分析”中进行了描述。来自生成的 Fab 和 Fc 片段的高质量信号和光谱分辨率导致能够观察 Fab 和 Fc 之间的结构变化、氧化和非氧化样品之间的差异，并通过观察原子分辨率来比较原研剂和生物仿制药的 HOS。
抗体的氧化是可能影响抗体功能的关键质量属性，需要密切定量和表征。它可能导致mAb的体内半衰期、功效和稳定性降低。Genovis的FabRICATOR（IdeS）消化产生的抗体亚基是研究抗体氧化的理想选择。酶解的稳健性允许在受监管的环境中监测抗体亚基氧化。Genovis的FabRICATOR（IdeS）是一种IgG特异性半胱氨酸蛋白酶，可消化铰链下方单个氨基酸位点的抗体，产生均质的F（ab'）2和Fc片段。该酶用于基于抗体的疗法（如mAb、ADC、生物类似药和Fc融合蛋白）的表征、质量控制、稳定性测试、生产监测和克隆选择。高度特异性-铰链下方的一个消化位点快速–在30分钟内生成均匀的片段池实现基于抗体的生物zhiliao药物的表征和质量控制可固定在即用型离心柱中Genovis的IdeS蛋白酶是IgG特异性半胱氨酸蛋白酶。
一些应用（如结合研究）具有高度灵敏度，因此在制备中需要不含残留酶的纯抗体片段。因此，Genovis的 IgG 特异性蛋白酶也以固定化酶提供，可快速轻松地生成均质 F（ab'）2 和 Fc/2 片段。FabRICATOR Immobilized 含有固定化的 FabRICATOR （IdeS），用于制备来自多种 IgG 的 F（ab'）2 和 Fc 片段（对于兔 IgG，请咨询），而小鼠 IgG2a 和 IgG3 可以使用含有 FabRICATOR Z Immobilized 的 FabRICATOR Z Fab2 试剂盒进行处理 。 为了生成和纯化完整的 F（ab'）2 和 Fc/2 片段，使用 FabRICATOR Fab2 试剂盒处理曲妥珠单抗，并通过 SDS-page 进行分析。首先，在室温下在FabRICATOR固定化离心柱上消化抗体15分钟，然后进行短离心步骤。在 CaptureSelect ™ 离心柱上纯化 F（ab'）2 片段，并通过降低 pH 值，然后立即调整回中性 pH 值，一步洗脱结合的 Fc 片段。使用 FabRICATOR Fab2 试剂盒从酶切到收集片段的过程大约需要 1 小时Genovis提供半胱氨酸蛋白酶 FabALACTICA （IgdE）。湖北FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学
用 Genovis的GlySERIAS 在 37°C 下冻干消化1 小时。湖北FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学
样品制备的条件可能会在样品中诱发伪影，因此需要避免高温和碱性pH值进行质谱分析。如果可能的话，避免多个步骤并在一锅反应中进行消化和还原也可能是有益的。与IdeS不同，为了探索Genovis的GingisREX对离液剂和去液剂的稳定性和耐受性，在一系列试剂中测试了酶活性，并使用底物测定进行了评估。数据显示，GingisREX在6M时耐受尿素，吐温高达1%，但活性在0.1%时受到SDC的负面影响。该酶在 pH 值范围为 5.0 至 9.0 时显示出活性，在 pH 值为 6.5-8.0 之间。综上所述，GingisREX可用于一锅反应，以同时消化和变性6M尿素。与Genovis的IdeS不同，双特异性 T 细胞接合器 （BiTE） 分子是一种融合蛋白疗法，其中两个 scFv 融合，形成一个双特异性分子，其中一个 scFv 靶向细胞毒性 T 细胞，另一个靶向Ai症抗原。该蛋白质由四个蛋白质结构域组成，两个 scFv 均由 VL 和 VH 区域组成，总共由三个柔性 GS 连接子连接。这种蛋白质的大尺寸（54 kDa）可能对通过完整质谱法进行产品质量监测构成挑战，因为标准MS仪器可能无法提供蛋白质的单同位素分辨率。湖北FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学
Genovis除了提供IdeS酶以外，还提供很多种特异性蛋白酶，如半胱氨酸蛋白酶 FabALACTI...
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