企业商机
二代测序基本参数
  • 品牌
  • 嘉安健达
  • 型号
  • illumina novaseq6000
二代测序企业商机

二代测序应用于蛋白组测序的常见方式②?

结合质谱技术的联合分析

原理:质谱技术是目前蛋白组学中鉴定和分析蛋白质的**技术。它可以将蛋白质酶解成肽段后进行离子化,然后根据不同肽段在质谱仪中的质荷比等特征来确定肽段的序列,进而推导出蛋白质的序列信息。二代测序在这里的作用是辅助质谱分析,比如对样本进行转录组测序,获得基因序列信息,帮助构建蛋白质序列数据库。当质谱检测到肽段后,可以基于这个参考数据库更精细地匹配和鉴定出对应的蛋白质,同时也有助于分析蛋白质的可变剪接产生的异构体等复杂情况。

应用案例:在**研究中,获取**组织和相邻正常组织样本。先通过二代测序构建该组织对应的转录组序列数据库,然后利用质谱分析**组织中的蛋白,借助之前构建的数据库,能够准确鉴定出许多在**中特异性表达或表达量发生***变化的蛋白质,进一步研究这些蛋白质在**发***展中的作用,像发现某些参与细胞信号转导通路的蛋白出现异常表达,可能与肿瘤细胞的增殖、转移等特性相关。 在基因组研究方面,二代测序能够分析生物体的整个基因组,促进遗传变异、基因表达和基因组结构的研究。长宁区哪里有二代测序提供

chip-seq的技术优势与局限性

优势:具有高灵敏度,能够在全基因组范围内精确定位蛋白结合区域;***适用于各种蛋白质,包括转录因子、组蛋白修饰以及其他DNA结合蛋白;可提供单碱基分辨率的结合位点信息。

局限性:对抗体的特异性和质量要求高,劣质抗体可能导致非特异性信号;背景信号可能干扰目标峰的识别,尤其在低丰度蛋白研究中;可能无法捕获所有的蛋白结合位点,特别是结合较弱的区域;对于稀有细胞或样本量有限的情况,实验可能受到限制。 徐汇区嘉安健达二代测序原理二代测序产出的数据量有多少?

二代测序的建库步骤、末端修复和加A尾(以DNA文库为例)末端修复:经过片段化后的DNA末端可能是不平齐的,有5'-突出端或3'-突出端。末端修复反应可以利用T4DNA聚合酶、Klenow片段等酶,将这些末端补平,使其成为平末端。T4DNA聚合酶具有5'→3'聚合酶活性和3'→5'外切酶活性,在合适的反应缓冲液和dNTP(脱氧核糖核苷三磷酸)存在下,可以将突出的末端补平。加A尾:在末端修复后的平末端DNA分子的3'-末端加上一个A碱基。这一步是为了后续连接带有T-突出端的接头做准备,一般使用Klenow片段(3'→5'外切酶活性缺失)在dATP存在下进行加A反应,这样可以使DNA片段能够高效地与带有T-突出端的测序接头连接。

WES测序

局限性

检测范围有限:无法检测外显子间区域和非编码序列区域的变异,也不能覆盖整个基因.

对某些变异不敏感:在检测重复序列扩增、G-富集区域和GC含量高的区域等变异时,效果可能不佳.

应用

遗传病诊断与研究:可诊断病因不明的遗传病,明确致病突变,还能用于产前诊断,辅助家庭生育决策.

**研究:助力**基因突变检测,为**的早期诊断、***方案制定及预后评估提供依据.

药物基因组学:检测结果可指导医生选择靶向药物或进行基因***,实现精细医疗. 二代测序常用于产前的检测或诊断。

常见的二代测序类型②

靶向测序:聚焦于特定的基因或基因区域进行重点测序,如对已知与某种疾病相关的基因**测序,具有成本低、效率高、数据解析简单等优点,广泛应用于疾病诊断、药物靶点筛选和临床个体化***等.

微生物基因组测序:用于检测和分析环境、人体或其他样本中的微生物群落的基因组组成,可了解微生物多样性、功能及与宿主相互作用,在微生物生态学、传染病诊断、环境科学等领域有重要应用.

甲基化测序:主要研究DNA甲基化修饰情况,对基因表达调控等有重要意义,通过检测甲基化水平变化,可探究疾病发***展机制、寻找生物标志物及药物靶点等. 二代测序广泛应用于个性化医学。新疆哪里有二代测序运用

二代测序的特征是高通量,降低了测序成本的同时,还大幅提高了测序速度。长宁区哪里有二代测序提供

WES测序

WES测序即全外显子组测序,是基于二代测序技术的新型基因检测方法,以下是具体介绍:

原理

人类基因组中*1%-5%的外显子区域编码蛋白质,却包含约85%的致病变异。WES测序通过序列捕获技术富集外显子区域DNA,再利用高通量测序技术对其进行测序,***经生物信息学分析和比对,检测基因突变.

流程

包括DNA片段化和文库制备、测序和数据分析两步。先将DNA切割成100-300bp的小片段,以便放入文库;然后将片段与引物匹配,引物设计靠近外子边缘以提高捕获精密度和覆盖率,经PCR扩增和链分析得到测序数据,再对比分析重建原始DNA序列.

优势

检测效率高:外子区域占比较小,测序速度快,能更快为患者提供诊断信息.

性价比高:相比全基因组测序,成本较低,且可检测大量基因突变.

覆盖度好:可***覆盖外显子及医学相关区域,包括疾病关联位点和非翻译区.

变异发现能力强:能发现低频和罕见突变,为研究复杂疾病和罕见遗传病提供有力支持. 长宁区哪里有二代测序提供

二代测序产品展示
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