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二代测序基本参数
  • 品牌
  • 嘉安健达
  • 型号
  • illumina novaseq6000
二代测序企业商机

二代测序用于蛋白组测序的优势

高通量:二代测序本身具有一次性处理大量核酸序列的能力,在结合蛋白组测序相关应用时,能快速获取大规模的转录组数据,进而可以对众多潜在的蛋白质信息进行分析推断,相比传统逐个蛋白分析的方法,**提高了效率,能够在短时间内覆盖更***的蛋白组范围。

能发现新蛋白及异构体:借助对转录组的深度测序,可以挖掘出一些新的转录本,这些转录本有可能翻译出全新的蛋白质或者产生蛋白质异构体,有助于拓展对蛋白组复杂程度的认知,发现那些以往可能被遗漏的蛋白质种类和形式。 二代测序的优势是高灵敏度。湖南哪里有二代测序价格

二代测序——WES测序

WES测序即全外显子组测序,是一种基于二代测序技术(NGS)的基因检测方法。以下是其具体介绍:

技术流程

样本准备:通常从组织或血液样本中提取DNA,如EDTA-K2抗凝的外周静脉血。

DNA打断:使用超声波或酶等方法将DNA片段化,以便后续操作。

末端修复:对DNA片段的末端进行修复,使其能够顺利进行后续的测序反应。

文库制备:将DNA片段与测序接头连接,构建用于高通量测序的文库。

测序:一般使用Illumina测序平台对文库进行高通量测序,可获得大量的DNA序列信息。

数据分析:对测序得到的数据进行生物信息学分析,包括序列比对、变异鉴定等。

变异解释:识别外显子中的变异,如单核苷酸变异、插入或缺失等,并确定这些变异是否与遗传病有关。 北京嘉安健达二代测序价格二代测序通量大,可以产生上G的reads.

二代测序用于蛋白组测序的发展前景?

多组学整合更紧密:未来二代测序与蛋白组测序会和其他组学技术(如代谢组学、表观基因组学等)进一步深度整合,从多个层面***地解析生命活动分子机制,例如在疾病研究中,综合分析基因转录、蛋白质表达及代谢产物变化等,为疾病的早期诊断、精细***提供更完善的依据。

技术优化提升准确性:一方面,二代测序技术自身会不断改进,提高测序的准确性、降低错误率,并且在通量上可能进一步提升;另一方面,和蛋白组测序衔接的相关流程和分析方法也会不断优化,从而更精细地从转录组信息转化为可靠的蛋白组信息,推动蛋白组测序领域的发展。

二代测序的数据量

全基因组测序

一般人类全基因组测序,若测序深度为30x-50x,人类基因组大小约3Gb,则数据量在90Gb-150Gb之间。如进行高深度测序以发现更多低频突变等罕见疾病信息,测序深度达100x以上,数据量会超300Gb.

外显子测序

外显子总长度约30Mb,占全基因组1%左右,测序深度50x-100x时,数据量需1.5Gb-3Gb.

转录组测序

常规转录组测序,基础基因表达分析建议20M-30Mreads,数据量约5Gb-20Gb;检测低表达基因或复杂转录本拼装推荐50M-100Mreads,数据量相应增加;100Mreads以上属于高深度测序,适合解析复杂可变剪切事件和罕见转录本.长读长转录组测序,解析复杂转录本推荐数据量为5Gb-20Gb,研究全转录组复杂性建议单样本数据量>20Gb.

ChIP-seq

转录因子检测标准为20M-40Mreads,组蛋白修饰宽谱图则需要更高测序量. 基因组重测序是二代测序吗?

二代测序的建库步骤、末端修复和加A尾(以DNA文库为例)末端修复:经过片段化后的DNA末端可能是不平齐的,有5'-突出端或3'-突出端。末端修复反应可以利用T4DNA聚合酶、Klenow片段等酶,将这些末端补平,使其成为平末端。T4DNA聚合酶具有5'→3'聚合酶活性和3'→5'外切酶活性,在合适的反应缓冲液和dNTP(脱氧核糖核苷三磷酸)存在下,可以将突出的末端补平。加A尾:在末端修复后的平末端DNA分子的3'-末端加上一个A碱基。这一步是为了后续连接带有T-突出端的接头做准备,一般使用Klenow片段(3'→5'外切酶活性缺失)在dATP存在下进行加A反应,这样可以使DNA片段能够高效地与带有T-突出端的测序接头连接。二代测序即高通量测序技术。山西二代测序价格

二代测序读长方面比一代测序短很多。湖南哪里有二代测序价格

二代测序的操作流程有哪些?1.DNA提取与质检·纯净、足量、质量好的样本DNA是检测成功的基础(可以来源于血浆、新鲜组织等)2.DNA处理→文库构建·得到统一长度区间+有接头的DNA片段·步骤:DNA打断→末端修复→片段筛选→加A尾→接头连接→PCR3.靶向捕获·特定区域基因的定向检测4.上机测序·根据通量情况选择测序仪·上样后机器完成5.数据分析·初级分析:光强数据(不同荧光标记碱基)→序列信息(AGCT)·二级分析多仪器自带·三级分析vcf文件可diy湖南哪里有二代测序价格

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