生物肥对于果树主要有5大作用：一、改变根量，由细菌产生的IAA、GA、CTK使植物次生根增殖，增加有效根量。二、软化细胞壁，细菌产生的半聚糖醛酸转化酶（PATA）可软化根系细胞壁，从而促进营养吸收。三、产生转铁产物，细菌产生的转铁产物可聚合或螯合土壤铁，使之成为对果树更有效的物质。四、增加磷的有效性，细菌分泌出增加石灰性土壤中磷有效性的酸性物和螯合物。五、阻止病害，细菌改变根际环境，从而***根系病原体的竞争力。以邪压正，减轻病害。菌肥中在植物根系大量生长、繁殖，从而形成优势菌群.内蒙古原产地生物菌肥品质保障
与化肥混用，化肥用量过大高浓度的化学物质对菌肥里的微生物有毒害作用，尤其注意不能与碳酸氢铵等碱性肥料和硝酸钠等生理碱性肥料混用。没有因量制宜对于多年来用化肥的田块施用了生物菌肥不能大量减施化肥和有机肥，因农作物对化肥产生了依赖性，用生物菌肥取代氮肥不能一下子适应，因此，其取代理应做到***、二、三年分别取代30%、40%和60%。磷、钾肥只能补足，不能减少。没有因时制宜生物菌肥不是***肥，所以，要在作物的营养临界期和大量吸收期前7～10天施用效果比较好。正规生物菌肥零售价格因此，微生物菌剂与有机肥搭配施用，可将肥效达到1+1＞2的效果。
与化肥混用要注意化肥用量不能过大。高浓度的化学物质对菌肥里的微生物0害作用，尤其注意不能与碳酸氢铵等碱性肥料和硝酸钠等生理碱性肥料混用。***，注意千万不要与杀菌剂、杀虫剂、除草剂和含硫化肥，如***钾等以及稻草灰混合用，因为这些药、肥很容易杀死生物菌。在施用时，若施菌肥与防病虫、除草相矛盾时，可先施菌肥，隔48小时后，再打药除草。若拌种，切忌和已拌好杀菌剂的种子混合使用。同时还应防止与未腐熟的农家肥混用，因为农家肥在腐熟的过程中会发酵，这样会直接杀死生物菌。
适量施用。土壤中施入较多的菌肥，虽然不会出现烧根烧苗现象，但也并不是施得越多就越好。盲目大量施用生物菌肥，虽然不会向化学肥料那样造成蔬菜烧根死苗，只是蔬菜植株体内盐类积累增加，有害消费者的圣体健康，恶化土壤质地，但**起码增加了肥料投入成本（因为生物菌肥价格较高），降低蔬菜的栽培效益。因此，应根据不同作物的需要和土壤养分状况，科学地确定生物菌肥施肥量，才能达到增产增收的目的。在土壤状况比较正常的情况下，一般以亩（667平方米）施用生物菌肥80公斤左右为宜。如果土壤盐渍化程度较高，可适当增加生物菌肥的施用量。一般根据土壤的盐渍化程度高低，每亩（667平方米）可适当增施10～20公斤为宜。分解土壤中有机质，可减少氮素的流失，解钾溶磷提高肥料利用率，降低生产投入，减少资源浪费。
菌肥中的菌赖以生存的条件是有机质。而80%以上的果园都在施用无机化肥，土壤板结透气性差，使得一些厌气菌大量繁殖，如镰刀菌、齐整小核菌等，菌种的繁殖跟扩散需要有机质跟湿度合理搭配。更严重的是有机肥极度缺乏破坏了土壤的团粒结构，降低了土壤的保肥保水能力。果农施商品有机菌肥一般每亩都在40公斤左右，有机质很快被分解利用，有机肥中的菌种失去赖以生存的条件不能繁衍生存，大部分死亡。这就是果农在施用商品有机菌肥中发现的地厚施有机菌肥有作用而地薄无作用的道理。造粒后再加菌、加菌后不经过高温进行物理造粒，是可行的、成熟的工艺，不存在颗粒状微生物菌剂是假的。河北经济型生物菌肥技术指导
：生物菌肥采用天然的微生物技术，不含有害物质，对环境友好，符合可持续农业发展的要求。内蒙古原产地生物菌肥品质保障
首先，要选择正规厂家的产品。具备农业部微生物肥料登记证，包括：微生物菌剂登记证、生物有机肥登记证，或复合微生物肥料登记证；其次，要核对执行标准。农用微生物菌剂执行的是国家标准，为GB20287-2006，生物有机肥和复合微生物肥执行的是行业标准，分别为NY884---2012和NY/T798-2015；再次，要查看包装袋上菌数的标注。菌剂中的有效活菌数液体含量要≥2亿/克颗粒的要≥1亿/克，生物有机肥和复合微生物肥中的有效活菌数含量要≥2000万/克。在满足以上3个条件的情况下，用户可以根据所需要的功能选择含有特定功能菌种的微生物菌肥。菌肥的质量要看其所含“有效活菌”的数量，活菌越多效果约好，特别说明要是活菌！内蒙古原产地生物菌肥品质保障
