斑马鱼在基础研究领域的应用：发育生物学、基因功能研究、疾病发病机制研究等
1、斑马鱼可应用于发育生物学的细胞谱系分析、突变鉴别、饱和诱变分析、基因转移研究、基因连锁图的构建，其体外受精、胚体透明、细胞分裂快等特点使它比起大小鼠有独特优势。
2、基因功能研究：斑马鱼繁殖速度快，能提供足够量的胚胎用于基因筛选；其胚体透明的特点可以一目了然地观察到基因突变后的表型变化。
3、疾病发病机制研究：斑马鱼的***发生、疾病生理、基因组与人类相似度较大，主要信号通路和基因具高度同源性，诸多斑马鱼疾病（如血*、免疫性系统疾病、***疾病等）模型已建立，利用斑马鱼的疾病模型来研究***人类相关疾病是近年全球热点的科研项目。 斑马鱼实验用于生物医学研究。天津北大关于斑马鱼实验
环特生物拥有业内**的19项已授权斑马鱼发明专利技术和可持续研发能力，创建了130多项斑马鱼技术应用模型，应用“水中小白鼠”斑马鱼提供活性成分筛选、药物功效和安全性评价、食品、功能性食品和化妆品的功能及安全性评价等服务，并针对功能性食品、药品、化妆品、食品等众多行业提供可量化的产品评价服务与专业的技术解决方案。斑马鱼生物检测技术，面向全球多个国家和地区，在2016年杭州G20峰会食品安全检测、新药项目用于CFDA的临床试验申报等重大项目中得到特别应用。北京斑马鱼实验抗体斑马鱼生物功效及安全性评价技术。
斑马鱼由于养殖方便、繁殖周期短、产卵量大、胚胎体外受精、体外发育、胚体透明，已成为生命科学研究的新宠。全球范围内有超过1500个斑马鱼实验室。利用斑马鱼，可以研究生命科学的基础问题，揭示胚胎和组织***发育的分子机理；可以构建人类的各种疾病和**模型，建立药物筛选和***的研究平台；可以建立毒理学和水产育种学模型，研究和解决环境科学和农业科学的重大问题。
目前我国有250个以上的实验室利用斑马鱼开展相关科学研究。为进一步加强国内斑马鱼研究人员之间的交流，在2011年广州举办的第二届全国斑马鱼研讨会上，包括孟安明院士在内的全国斑马鱼研究学术集体商定，今后的全国性斑马鱼会议采取“PI大会”和“研究大会”的形式交替隔年举行，并决定自今年起固定在水生所召开“全国斑马鱼PI大会”。此次举行的斑马鱼PI大会也作为国家斑马鱼资源中心在水生所揭牌后所召开的一次学术庆祝大会。
模式生物斑马鱼的应用
斑马鱼在工业实验室中常被用作毒理学检验，是国际标准化组织推荐的五种实验鱼种之一。但随着对斑马鱼的进一步了解，其作为模式生物在生命科学以及医学研究中的作用正在崛起。
以斑马鱼为模型研究目的基因在脊椎动物中的表达和功能
利用斑马鱼胚胎透明的特点，构建绿色荧光蛋白（GFP）与内源性靶蛋白的融合蛋白，通过观察融合蛋白的荧光分布情况，借以确定目的基因或目的蛋白的功能和表达特点。同时，还可通过检测绿色荧光的分布，监测外源蛋白的表达在斑马鱼中的表达与分布情况。斑马鱼在工业实验室中常被用作毒理学检验。
心血管病
这些鱼类也主要用于研究心血管疾病，因为它们具有与人类胚胎相似的胚胎心脏结构。此外，斑马鱼的优点是能够在没有足够的心脏循环的情况下生存。
氧气进入斑马鱼胚胎，通过被动扩散到达其他组织。这种独特的特征有助于胚胎从初始阶段发育，尽管有心血管缺陷。他们在这一领域的应用的一个例子是探索炎症和心肌梗死之间的联系。
神经病学
由于人类和斑马鱼大脑中存在大量相似的信号蛋白，因此该模型也被***用于神经系统疾病的研究。几种人类神经系统疾病在这些鱼类中也有对应的疾病。
例如，独眼针头是斑马鱼的变种，它有一个较小的腹侧大脑，只有一只眼睛。这与人类疾病“无脑症”相比较，在这种疾病中，病人有一个小的大脑和一只眼睛。这种比较使得能够鉴定与这种状况相关的几个基因，例如CFC1。 斑马鱼体外细胞学等生物检测。天津北大关于斑马鱼实验
斑马鱼实验模型在国内的兴起。天津北大关于斑马鱼实验
斑马鱼血管生成基因如血管内皮细胞生长因子（VEGF）、an-iopoietins、ephrions及相应受体与哺乳动物功能相似，而且斑马鱼血管系统及其对调节血管新生类药物的***反应与哺乳动物类似。另外斑马鱼胚胎在血液循环系统严重缺陷的情况下仍能存活，且胚胎透明，利用血管转基因荧光斑马鱼可以在24小时以内就定量评价药物的血管形成***作用。
与传统的鸡胚尿囊膜、小鼠角膜实验相比，斑马鱼更加便捷、快速、高效，而且结果定量分析的准确度更高。
目前多个出于临床试验阶段的抗血管生成靶向候选***药如SU5416、SU6668、TNP470、SU4312和AG1478等均对斑马鱼的血管形成有***的***效果。用斑马鱼筛选发现具有血管形成***活性的中***体化合物也有很多，如靛玉红、呋喃二烯等。 天津北大关于斑马鱼实验
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