数字PCR通过将一个样本分成几十到几万份，分配到不同的反应单元（微滴），包含一个或多个拷贝的核酸分子(也就是说我们所说的 DNA 模板) ，这是与PCR或qPCR反应比较大的区别，PCR或qPCR只在一个反应体系中进行，而数字PCR在每个反应单元（微滴）中都会对目标分子进行扩增，扩增结束后统计荧光信号并分析。是不是听起来特别高(yi)大(lian)上(meng)？举个栗子，PCR或qPCR检测突变像是在大海里捞一个会发光的针，周围都是海水，很难看到针的光在哪，而dPCR就像把海水盛到好多个碗里面，瞧一眼很容易就知道哪个碗在发光了，而且，系统还会数出来到底有多少个碗里是发光的，多少个碗里是没发光的，这样一比，不就很容易的知道有多少数量的突变，就能做到***定量了。
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数字PCR（Digital PCR-dPCR）技术是一种新的核酸检测和定量方法，与传统定量PCR（qPCR）技术不同，数字PCR采用***定量的方式，不依赖于标准曲线和参照样本，直接检测目标序列的拷贝数。由于这种检测方式具有比传统qPCR更加出色的灵敏度和特异性、精确性，dPCR迅速得到***的应用，这项技术在极微量核酸样本检测、复杂背景下稀有突变检测和表达量微小差异鉴定方面变现出的优势已被普遍认可，而其在基因表达研究、microRNA研究、基因组拷贝数鉴定、**标志物稀有突变检测、致病微生物鉴定、转基因成分鉴定、NGS测序文库精确定量和结果验证等诸多方面具有的广阔应用前景已经受到越来越多的关注。
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同时，从公式也可以看出，随着反应阳性体系数（X）的增加，体系中目标分子的拷贝数相对于X会有较大的差距，随着X的持续增加，数字PCR结果的不确定度也随着提高，总体来说，数字PCR阳性体系的数量不得超过总体系数量的80%。另一个方面，N的增加会使整个数字PCR体系具有较大的线性范围，并可以提高反应的灵敏度、稳定性以及可重复性。因此，目前dPCR都需要在成本可控的情况下，增加分配的腔室数和液滴数。

商业化dPCR平台及其特点

发展到现在，市面上常见的dPCR主要有两种：微滴式dPCR（droplet dPCR，ddPCR）和芯片式dPCR（chip dPCR，cdPCR）技术。由于芯片式dPCR制造芯片的成本较高，目前微滴式dPCR正越来越受到企业的认可。

每种PCR方法对比如下：

研究方向

基因表达差异研究

检测时完全不依赖传统的Ct值即可实现真正意义上的***定量，从而提供了比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究，尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况：microRNA、lncRNAs等的表达分析、等位基因的不平衡表达、单细胞基因表达分析、Exosome内核酸分子定量分析等。

拷贝数变异(CNV)研究

微滴化的样品处理及检测，这种摆脱Ct值的计算方法而直接获取目标基因的***拷贝数，为拷贝数变异的研究提供了***的检测精度。是其他诸如二代测序、芯片杂交等平台无法达到的，因此采用数字PCR能够有效对NGS、aCGH的实验结果进行验证，并具有成本低、通量高的特点。

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研究方向

低丰度及稀有序列的精确定量

目前对于低丰度目标序列的检测，定量PCR、杂交、毛细管测序及NGS等方法都因受到背景DNA的干扰，使得检测灵敏度及精确性都达不到精细定量的要求(如定量PCR检测中Ct值大于33的情况下，其重复性就不是很高)， 而微滴式数字PCR系统通过**的微滴化处理，使得稀有的核酸序列从大量的背景DNA中分离出来，从而提高了检测的灵敏度及重复性。

此外，由于样品微滴化处理的同时，也将样品中可能存在的***剂进行了分装，提高了数字PCR扩增对于***剂的耐受程度，因此可具体应用于很多临床样品(血液、尿液、粪便、痰液、脑脊液等)中对**核酸标记物的检测。一般而言，毛细管电泳和定量PCR的检测灵敏度约在10%;NGS的灵敏度可达到1%;而ddPCR的检测下限为0.001%。 南通JUE对定量数字PCR现货