云南肠道菌群检测临床应用

AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一项新研究，对类风湿关节炎（RA）患者及健康人的肠道菌群进行了宏基因组关联分析，鉴定出了一些与RA相关的菌种及菌群功能，并发现了一些具有人种特异性的RA相关的宏基因组-宿主基因组关联，提示宿主基因组、肠道菌群及RA的发病机制之间存在密切联系。①纳入82名类风湿关节炎（RA）患者及42名健康对照，对肠道菌群进行全基因组深度测序；②RA患者的肠道菌群宏基因组中，普氏菌属中多个菌种的丰度高于健康人；③RA患者的肠道菌群宏基因组中，R6FCZ7（与氧化还原反应相关的基因）的丰度明显低于健康人，而代谢相关通路（脂肪酸生物合成、粘多糖降解等）明显富集；④通过对比宏基因组关联分析（MWAS）与全基因组关联分析（GWAS），鉴定出一些RA相关的宏基因组-宿主基因组之间相关的通路。肠道菌群检测的方法；云南肠道菌群检测临床应用

来自广东省中医院的黄闰月团队与黄清春团队在Frontiers in Immunology上发表的一项研究，对比了类风湿关节炎（RA）患者与健康对照的肠道菌群组成及功能差异，并对比了接受不同药物***后，RA患者的肠道菌群组成及功能的变化。①纳入22名RA患者及22名健康对照，13名患者接受化瘀强肾通痹方（HQT）+甲氨蝶呤，9名患者接受来氟米特（LEF）+甲氨蝶呤；②相比于健康对照，RA患者分别有的37个及21个肠道细菌物种富集或减少，维生素K2生物合成与RA患者中富集的细菌相关；③HQT组与LEF组患者的临床疗效相似，HQT影响红细胞沉降率，LEF影响C反应蛋白水平；④用药后，HQT组及LEF组患者分别有11个及4个肠道细菌物种，以及9个及2个菌群代谢通路发生变化。山东肠道菌群检测私人定制上海沃本——肠道菌群检测服务商；

目前，幽门螺杆菌为大众所熟知的就是它作用于胃炎进展到胃cancer的每一个阶段。我们知道它是胃cancer的一个1类致cancer因子，关注幽门螺杆菌和胃病的人，都说它是胃cancer发生的可控因素。幽门螺杆菌***降低了胃微生物群的多样性和组成，根除幽门螺杆菌是有助于正常的胃微生物群的恢复的。根除幽门螺杆菌对肠道菌群的多样性和组成的影响是比较剧烈的，那么它的远期的影响可能较小。益生菌可以明显地降低Hp根除改善引起的胃肠道不良反应。益生菌也是可能提高幽门螺杆菌根除率的，现有的证据只能显示，使用含乳杆菌的菌株、改善前使用7~14天可能会更好。

GenomeMedicine近期发表的文章，通过对RA病人的粪便菌群进行宏基因组测序分析，发现RA患者中存在与疾病活动指数——MCII相关的肠道菌群的分类和功能特征，且利用肠道菌群特征进行AI训练预测哪些患者MCII状态会发生改变，效果明显。提示我们改变肠道菌群以提高临床疗效可能是RA未来的希望。①对1988年-2014年间诊断为RA的患者进行回顾性、观察性队列研究，收集64份粪便样本进行宏基因组测序；②年龄是导致肠道菌群组成差异的比较大决定因素，其次是疾病活动指数——MCII状态，且MCII+和MCII-患者的基线肠道菌群特征、功能性生化途径都存在明显差异；③基线检查和随访中，取得临床改善的患者肠道菌群的α多样性较高；④神经网络利用肠道菌群预测哪些患者MCII状态会发生改变，被证明是非常有效的，证明了肠道菌群的潜在临床实用性。如何检测肠道菌群的差异性！

药物微生物组学是一门新兴学科，关注药物与菌群之间的复杂互作。Nature Reviews Rheumatology上发表的一篇综述文章，详细介绍了在炎症性关节炎（包括类风湿关节炎、银屑病关节炎及强直性脊柱炎）中，肠道菌群如何通过调节药物的生物利用度、活性及毒性，以影响药物的改善效果，并讨论了如何将药物微生物组学应用于炎症性关节炎的精细医疗之中。①在多种疾病中，药物-菌群互作可影响患者对药物改善的应答；②肠道菌群及其代谢产物可调节炎症性关节炎改善药物的生物利用度、临床疗效及毒性；③例如，柳氮磺胺吡啶可被肠道菌群代谢为活性形式，而甲氨蝶呤可被肠道菌群代谢为非活性形式；④药物微生物组学研究用于炎症性关节炎精细医疗的潜在策略包括：肠道菌群作为预测改善应答的生物标志物、调控菌群以增加药物的生物利用度及疗效、抑制特定细菌酶活性以防止其将药物代谢为毒性产物。肠道菌群与人类健康息息相关！江苏腹泻菌群检测预测疾病

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自从引入了细菌的基因组学分析以来，针对微生物的研究已经产生**性变化。16SrDNA测序和宏基因组测序两种测序方法，常用于评估微生物组成机器相对丰度。16S测序可以以可变区域周围的稳定区域为八项来检测细菌基因组中高变异度区域的差异。这一技术的主要缺陷在于无法分辨种群之间的差异，因为这种差异通常很小。相反地，宏基因组测序能够实时检测所有生物的全基因组，这也造成针对意志和位置的微生物检测的精度增加。本章阐述了与心血管疾病相关的肠道微生物组成的变化。云南肠道菌群检测临床应用

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