Genovis的OglyZOR 是一种内切糖苷酶(O-糖苷酶),可特异性水解天然糖蛋白上的he心 1 O-聚糖。OglyZOR 用于去除 O-糖,用于糖分析、确认 O-糖的存在和降低样品的异质性。Genovis的OglyZOR 是一种内切糖苷酶(内切-α-N-乙酰半乳糖氨酸酶),可催化来自天然糖蛋白的he心 1 和有限程度的he心 3 O-聚糖的水解。 OglyZOR酶活性需要去除唾液酸,因此,由唾液酸酶混合物组成的唾液酸冻干,用于去除α2-3,α2-6和α2-8连接的唾液酸,与OglyZOR一起提供。在pH 6.5至7.5和37°C下获得良好活性。由于GlycOCATCH树脂和O-糖蛋白/肽之间的强相互作用。甘肃冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶
Genovis的SialEXO产品是用于去除和分析唾液酸的唾液酸酶。这些酶对天然糖蛋白或游离的聚糖结构上存在的 N- 和 O-连接聚糖均具有活性。SialEXO用于在用OpeRATOR或OglyZOR消化之前预处理O-糖基化蛋白。其他应用包括降低样品复杂性、电荷异构体分析和外切糖苷酶阵列。N-连接、O-连接和游离聚糖的高效去唾液酸化快速去除唾液酸,增强对蛋白质电荷变体的分析可固定在即用型离心柱中。然后可以用FabRICATOR消化所得的去糖基化蛋白,并通过中级质谱分析。我们将该工作流程应用于依那西普的分析,虽然未经处理的TNFR结构域过于复杂而无法分析,但O-聚糖组成可以在用PNGase F处理后进行分离和比较。湖南固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶PNGase F是一种非常成熟的工具。O-糖的去除可能更具挑战性,现有的O-糖释放化学方法不太适合下游分析。
ImpaRATOR 是一种 O-聚糖依赖性蛋白酶,可催化糖蛋白和糖肽中与糖基化丝氨酸或苏氨酸残基相邻的肽键的水解。它切割用粘蛋白型O-聚糖修饰的丝氨酸或苏氨酸残基的N-末端,包括唾液酸化物种。粘蛋白型O-聚糖是ImpaRAT活性所必需的,该酶不会消化未修饰的丝氨酸或苏氨酸残基,也不会在糖蛋白的N-糖基化位点。该酶接受 O-聚糖结构,包括唾液酸化he心 1 和he心 2 结构以及 Tn 抗原。Genovis的ImpaRATOR 来源于铜绿假单胞菌,在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签,分子量为 97 kDa。
当在完整状态下进行分析时,EPO的聚糖异质性导致了非常复杂的质谱图。通过在 37°C 下在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时,可以有效地去除 N 糖(含有PNGase F酶)和 O-糖,如对应于未修饰蛋白质的单个峰所示。EPO上残留了少量用乙酰化唾液酸修饰的O-聚糖,因为OmniGLYZOR对这种结构的水解效率低下。根据制造商Genvois的建议(在37°C下进行O/N孵育),两种底物蛋白也用另一种市售的去糖基化产物处理,并显示数据以供比较。另一方面,N-聚糖在内质网中翻译地连接到未折叠的蛋白质上。这导致某些 N-糖基化位点难以被 Genovis的PNGase F 接近,或者一旦底物蛋白折叠成其天然状态,就根本无法接近。因此,这种N-聚糖的水解需要底物蛋白以与酶活性相容的方式变性。将OglyZOR酶与依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或没有 SialEXO 孵育 1 小时。
在Genovis的PNGaseF去除N-聚糖并用SialEXO和GalactEXO截断O-聚糖后,在质谱图中观察到几个与GalNAcs相关的峰。为了去除剩余的GalNAc残基,应用GalNAcEXO酶。用GalNAcEXO处理后观察到的单个蛋白峰显示完全去除剩余的GalNAcs。 GalNAcEXO在生理缓冲液和中性pH值中具有活性,使其与大多数样品相容。此外,GalNAcEXO的活性不依赖于任何可能影响LC-MS分析的辅因子,如BSA。根据底物的性质,糖蛋白的GalNAcEXO反应在2小时内完成,而更复杂的样品可能需要孵育过夜。Genovis的GalNAcEXO也可固定在离心柱中,以便快速方便地处理样品,在制备过程中不会残留酶。现O-糖基化药有Tn抗原,定量he心 GalNAc 水平,减少了异质性。湖南固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶
使用游离聚糖方法分析zhiliao性抗体曲妥珠单抗、Fc-融合蛋白依那西普和糖蛋白RNase B的N-聚糖。甘肃冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶
与PNGase F类似,Genvois的OmniGLYZOR 水解 N-和粘蛋白型 O-聚糖:糖基化往往是异质的,这使得对高度糖基化的生物zhiliao药物的分析具有挑战性。完整质量数的确认以及其他产品质量属性的表征受到不同糖型复杂性的阻碍,这就是为什么有效的聚糖去除工具简化了此类分析的原因。 虽然 N-聚糖包含一个共同的结构,并且可以通过 PNGase F 整体去除,但粘蛋白型 O-聚糖在结构上更加多样化,具有多个不同的he心。OmniGLYZOR含有固定化酶的混合物,能够依次分解O-聚糖,以完全去除最常见的O-聚糖结构(二唾液酸和单唾液酸基he心1和Tn抗原)。甘肃冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶
GlycOCATCH设计用于特异性结合粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽。亲和树脂基于无活性的Genovis...
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