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PNGaseF去糖基化酶基本参数
  • 品牌
  • Genovis
  • 型号
  • L1-F02-025
PNGaseF去糖基化酶企业商机

Genovis的GlycOCATCH®是一种亲和树脂,可特异性结合O-糖基化(粘蛋白型)蛋白和肽,从而实现简单的工作流程,以富集和纯化携带O-聚糖的蛋白质和肽。洗涤离心柱,并用8M尿素洗脱结合的蛋白质。对洗脱材料的分析表明,由于洗脱O-糖基化蛋白,并且树脂与非糖基化蛋白和N-糖基化蛋白的结合可以忽略不计。选择性结合 O-糖蛋白:为了测试选择性,将一系列 O-糖基化、N-糖基化和非糖基化蛋白与Genovis的GlycOCATCH 一起孵育。为了在肽水平上研究Genvois的GlycOCATCH的O-糖特异性,将O-glcyosyled肽(糖蛋白)与一系列未修饰的肽混合。OpeRATOR用于质谱法进行O-糖分析、O-糖肽图谱以及中级分析,消化发生在O-糖基化位点的N端。海南PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

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与PNGase F类似,Genvois的OmniGLYZOR 含有固定化酶的混合物,可快速有效地去除抗体、融合蛋白和其他糖基化蛋白上的 N 和简单的粘蛋白型 O-聚糖。聚糖的去除被用于减少异质性,以促进蛋白质的分析,例如质谱法。去糖基化也可用于研究聚糖的功能作用。N-和粘蛋白型O-连接聚糖的快速高效去糖基化;即用型离心柱形式 - 无酶干扰分析;与LC-MS兼容。与PNGase F类似,Genvois的与PNGase F类似,Genvois的OmniGLYZOR 含有去除 N-糖和最常见的粘蛋白型 O-糖所需的酶,即单唾液酸和二唾液酸he心 1 和 Tn 抗原 (α-GalNAc)。OmniGLYZOR Microspin 小柱中包含以下组分:PNGase F;O-糖苷酶。海南PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究用SialEXO对依那西普糖蛋白去唾液酸化,并用ProteinSimple成像等电聚焦分析。

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genovis的FucosEXO在生理缓冲液和中性pH值中具有活性,使其与大多数样品相容。此外,FucosEXO活性不依赖于任何可能影响LC-MS分析的辅因子,如BSA。根据底物的性质,FucosEXO 可在 1 至 2 小时内水解糖蛋白上的末端 α1-2,3,4 连接的岩藻糖残基,而对于非常复杂的样品可能需要更长的孵育时间。FucoseEXO也可固定在离心柱中,可快速方便地处理高达0.5mg的糖蛋白。使用离心柱形式,将糖蛋白样品与固定化的FucosEXO树脂一起孵育,然后在离心步骤中轻松收集消化的糖蛋白。

蛋白质的N-糖基化特征是一个关键的质量属性。它会影响生物制药的安全性和有效性,因此需要在开发和生产过程中进行表征和监测。常见的聚糖分析工作流程是用PNGase F释放N-聚糖,然后用荧光标记物(如2-AB、2-AA、普鲁卡因胺或RapiFluor-MS™(沃特世公司))标记生成的聚糖。然后使用HILIC-HPLC或毛细管电泳分离标记的聚糖,以表征和定量不同的聚糖结构。 在这里,使用游离聚糖方法分析zhiliao性抗体曲妥珠单抗、Fc-融合蛋白依那西普和糖蛋白RNase B的N-聚糖。曲妥珠单抗和依那西普在天然条件下在37°C下用Genvois的PNGase F去糖基化1小时,而RNase B需要变性和还原才能完全去糖基化。因此,在50°C下用PNGase F去糖基化10分钟之前,用RapiGest™ SF表面活性剂(沃特世公司)和TCEP处理RNase B。 用RapiFluor-MS标记所得游离的聚糖,并通过HILIC UPLC-FLD-MS进行分析。用于LC-MS分析之前制备样品,以鉴定其他PTM或确认氨基酸序列。

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与PNGase F类似,Genvois的OmniGLYZOR 水解 N-和粘蛋白型 O-聚糖:糖基化往往是异质的,这使得对高度糖基化的生物zhiliao药物的分析具有挑战性。完整质量数的确认以及其他产品质量属性的表征受到不同糖型复杂性的阻碍,这就是为什么有效的聚糖去除工具简化了此类分析的原因。 虽然 N-聚糖包含一个共同的结构,并且可以通过 PNGase F 整体去除,但粘蛋白型 O-聚糖在结构上更加多样化,具有多个不同的he心。OmniGLYZOR含有固定化酶的混合物,能够依次分解O-聚糖,以完全去除最常见的O-聚糖结构(二唾液酸和单唾液酸基he心1和Tn抗原)。O-糖基化蛋白和肽的特异性富集:包括抑制病原体引起的gan染、炎症反应、造血和细胞信号传导。海南PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

OmniGLYZOR特点:与LC-MS兼容;完全去除聚糖,改进蛋白的分析;海南PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

Genovis的ImpaRATOR™ 和 OpeRATOR® - 两种协同的作用:O-糖蛋白酶。使用ImpaRATOR或OpeRATOR消化后分析依那西普重糖基化区域O-聚糖位点的覆盖率(图3)。使用OpeRATOR鉴定对应于所有13个O-聚糖位点的肽,而使用ImpaRATOR只能明确鉴定10个位点。ImpaRATOR 可能比 OpeRATOR (1) 具有更具选择性的氨基酸序列偏好,此处由 S186 和 T245 位点缺乏消化来表明。此外,ImpaRATOR 在两个相邻的 O-糖基化氨基酸之间显示出有限的裂解,如 S213 位点酶解肽的缺乏以及 T200 和 T217 位点酶解肽的低强度所证明的那样。在OpeRATOR酶解样品(T184-S199和T200-H204;图2b和d),而在ImpaRATOR消化的样品中,具有漏裂的相应肽(S184-H204)的强度更高。 虽然OpeRATOR显示出更高的O-聚糖位点覆盖率,但使用ImpaRATOR进行消化可以表征O-聚糖结构,包括唾液酸化物种。例如,条形图插入显示了两种糖肽 T184-V198 和 T205-P207 的 O-聚糖种类。这应该与使用OpeRATOR的消化进行比较,在OpeRATOR中,必须去除唾液酸才能产生酶活性,这意味着有关唾液酸化的信息丢失。总而言之,ImpaRATOR 和 OpeRATOR 酶共同提供了有关聚糖组成和 O-聚糖位点的完整信息。海南PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

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