灰柠檬链霉菌

堀越氏芽孢杆菌（Bacillus horikoshii）是20世纪90年代由日本科学家堀越等从碱性温泉沉积物中分离出的嗜碱菌，也是国际公认的模式菌株（ATCC 700161）[ ^82^ ][ ^84^ ]。菌体杆状、革兰氏阳性，可形成椭圆芽孢，更适pH 8.5–9.5、温度30–37 ℃，在Na₂CO₃浓度50 g L⁻¹的极端环境中仍能正常代谢，被称为“天然碱性细胞工厂”。一、耐碱机制基因组编码多拷贝Na⁺/H⁺逆向转运蛋白（mnh、nhaC）和碳酸酐酶，可将胞内多余Na⁺排出，并将CO₃²⁻转化为HCO₃⁻，维持胞内pH稳态；细胞壁肽聚糖含高比例二氨基庚二酸，增强膜稳定性，为高温高碱酶的高效表达提供平台。二、工业酶潜力其耐碱淀粉酶、普鲁兰酶更适pH 9–10，90 ℃半衰期>2 h，已用于淀粉糖化“一步法”，可省略传统工艺中的中和环节，节能15 %；耐碱蛋白酶在洗涤剂中可去除血渍、奶渍，低温活性优于市场同类酶20 %。三、农业与环境应用菌株P1具备“溶磷-钝化重金属”双重功能：在pH 9、Cd²⁺ 50 mg kg⁻¹条件下，仍可将难溶磷酸钙转化为磷277 mg kg⁻¹，同时胞外多糖吸附Cd²⁺，使水稻籽粒镉含量下降35 %，产量提高18 %。

格雷厄姆氏根瘤菌是豆科家族里更“挑剔”的房客，却只认花生这一位房东。它自带“门禁卡”——特殊的Nod因子，能精细识别花生根毛分泌的染料木苷，两者对接成功，根毛便卷曲成螺旋，把菌请进“地下别墅”。随后，细菌释放信号，诱导根部细胞分裂，三天鼓出乳白根瘤，像给根系挂上微型氮肥厂。瘤内氧气被植物合成的豆血红蛋白调到纳摩级，固氮酶安全开工，将空气中惰性的N₂转化为NH₄⁺，昼夜输送给花生，亩产蛋白因此提升三成，农户少施20公斤尿素，却多收一筐饱满果仁。更妙的是，收获后根瘤遗落田间，氮素缓慢释放，后茬小麦吸氮量提高15%，土壤硝态淋失减少四成，地下水不再“又咸又绿”。如今，科研团队把菌液做成铝箔袋装，拌种即可，比化肥便宜三成，却无污染；还植入耐旱基因，让它在华北旱地也能结瘤。小小格雷厄姆氏根瘤菌，用微米之躯撬动绿色农业，让蓝天少一缕烟，田里多一季香。新疆微杆菌它能够产生多种酶，如蛋白酶和纤维素酶，这些酶在食品加工和生物燃料生产中具有潜在用途。

耐热芽孢芽孢杆菌（Geobacillus stearothermophilus，旧称Bacillus stearothermophilus）是微生物世界的“高温铁人”。其更适生长温度55–65 ℃，芽孢可耐100 ℃沸水2小时、紫外线辐照8小时仍存活，被广用于检验高压灭菌效果。该菌的耐热密码在于：细胞膜富含支链脂肪酸和钙-吡啶二羧酸复合物，降低膜流动性；组蛋白样蛋白紧紧包裹DNA，防止高温断裂；同时拥有一套高效热休克蛋白（Hsp）系统，可快速修复变性蛋白。在工业酶领域，耐热芽孢芽孢杆菌是“催化剂工厂”。其分泌的耐高温α-淀粉酶在90 ℃、pH 6.0条件下活性比较高，可将淀粉液化时间缩短一半，广用于酒精、制糖、纺织退浆，年市场需求超万吨；耐热蛋白酶则在60 ℃仍保持80%活性，可用于洗涤剂，提高低温洗衣的去污力。此外，该菌还能合成耐高温木聚糖酶和脂肪酶，在造纸漂白和生物柴油合成中展现潜力。农业与环境方面，科学家将其与堆肥菌系复配，使堆温迅速升至65 ℃，加速有机质分解，杀灭病原菌和杂草种子，缩短堆肥周期30%；在油田，耐热芽孢芽孢杆菌可耐受55 ℃、高盐环境，利用原油为碳源，产生生物表面活性剂，提高采收率5–8%。

盐反硝化枝芽孢杆菌（Virgibacillus halodenitrificans）是芽孢杆菌科中兼具“嗜盐”与“反硝化”双重技能的稀有物种。模式菌株 ATCC 49067 分离自法国太阳能盐场，可在 2–23 % NaCl、10–45 °C 范围内生长，更适盐度 3–7 %、pH 7.4–7.5，细胞壁含 meso-DAP，肽聚糖厚且膜脂分支，赋予其耐高渗与碱胁迫的能力。一、盐中反硝化该菌携带完整的 narG/napA-nirK-nor-nosZ 基因簇，能在 3–12 % 盐度下将 NO₃⁻ 依次还原为 N₂，并同步积累四氢嘧啶作为相容溶质，既完成脱氮又抵御渗透冲击。实验室摇瓶试验显示，盐度 8 % 时其对 NO₃⁻-N 去除率仍达 90 % 以上，N₂O 释放量低于检测限，为高盐废水生物脱氮提供了“零碳源”方案。二、油田与暗管应用菌株 WH-6 被制成“热-盐双耐”菌剂，在 55–80 °C、0.5–3.5 % NaCl 的采出水体系中，通过优先利用 NO₃⁻ 作电子受体，抑制硫酸盐还原菌活性，使 H₂S 产量下降 70 %，延长注水井管柱寿命。同时，含该菌的清淤剂与多孔沸石复配，用于盐碱地暗管排盐，一年后盐水收集率提高 35 %，出口浑浊度降至 4.7 mg L⁻¹，明显缓解因泥沙堵塞造成的维护难题。三、农业与生态修复在 1 % 盐度盆栽中，接种 10⁷ CFU g⁻¹ 土壤，可使生菜根际钾提高 20 %，硝酸盐含量下降 15 %，产量增 12 %。

长赖氨酸芽孢杆菌（Lysinibacillus macroides）是2013年从鲤肠道中分离的新成员，因细胞呈长杆、链状排列而得名。它能在1/2LB培养基上形成浅褐色、光滑、直径约1mm的菌落，革兰氏阳性，具周生鞭毛，可产卵圆形芽孢，耐pH6–9、盐0–6%，更适温度35–37℃，对干旱、高温和胆汁盐均有良好适应力。其“本领”在于三酶合一：吲哚乙酸（IAA）分泌量达18mg/L，可刺激小麦根长增加35%；ACC脱氨酶活性降低植物乙烯水平，缓解盐胁迫；铁载体与蛋白酶协同，可抑制番茄青枯、辣椒疫霉等病原菌，抑菌带宽22–28mm。山东大棚试验显示，用长赖氨酸芽孢杆菌菌液灌根，番茄根结线虫侵染率下降42%，果实Vc含量提高12%，产量增8.3%。工业端，菌株ZJB-17009的酯酶对N-苯乙酰-DL-氨基酸水解选择性达99%，已被用于绿色合成L-氨基酸；另一株C1在白酒窖池可产己酸和乙酸乙酯，使基酒主体香提高30%，为“增香菌”提供新选择。未来，借助合成生物学，长赖氨酸芽孢杆菌有望被植入耐盐、产聚-γ-谷氨酸模块，成为盐碱地“一菌多效”的先锋，让贫瘠土地也飘出丰收香。其基因组已被测序，为分子生物学和生物技术研究提供了丰富的资源。刺孢小单孢菌绛红变种

玉米侧IAA提升68%，秃顶缩短27%，增产18.6%，相当于少施25 kg复合肥仍多打粮。灰柠檬链霉菌

蔬菜芽孢杆菌（Bacillus oleronius）是芽孢杆菌属里“更懂蔬菜”的专性住客。更初从腐烂生菜叶脉中分离，菌体纤细、革兰氏阳性，具周生鞭毛，能形成椭圆芽孢，耐干燥、耐低氧，可在pH 5–9、温度15–40℃范围内生长，更适与蔬菜根际环境高度重叠，故得名“oleronius”（拉丁语“菜园的”）。它的首要武器是“蔬菜定制”抑菌谱。菌株QSI-1可分泌酰基高丝氨酸内酯酶（AHL-lactonase），切断软腐欧文氏菌、胡萝卜果胶杆菌的群体感应信号，使病原菌无法启动果胶酶基因，白菜软腐病斑减少70%；同时产生表面活性素与fengycin，对番茄叶霉、辣椒疫霉抑菌带宽达28 mm，且能形成生物膜覆盖伤口，阻止二次侵染。第二技能是“温和促生”。蔬菜芽孢杆菌合成IAA 20 mg/L，并溶出有机磷3.2 mg/L，诱导生菜、菠菜根系增30%，叶绿素提高1.5个SPAD单位，硝酸盐含量下降12%，明显提升蔬菜品质与安全。工厂化应用上，研究者将菌株QSI-1与褐藻寡糖复配，制成活菌数10⁸ CFU/mL的“蔬菜保鲜微乳”，采后喷施可抑制软腐、灰霉，使生菜货架期由7 d延至14 d，失重率<5%，已在上海崇明有机农场示范推广。灰柠檬链霉菌