与IdeS不同,融合蛋白是通过将两种或多种蛋白质或肽的功能组合成一个量身定制的分子来创造的,以专门应对挑战。连接此类蛋白质或肽结构域的常见方法是包含柔性连接子。这些连接子通常富含甘氨酸,例如甘氨酸残基(G),或甘氨酸残基散布丝氨酸残基(GS)以形成重复序列。这为连接子提供了足够的灵活性,不会干扰连接蛋白质结构域的功能。然而,这些新模式带来了新的分析挑战,需要新的工具来促进表征和产品质量监测。中级分析已成为分析单克隆抗体疗法的标准方法,涉及将分子消化成几个定义的亚基。它们足够小,可以获得高质量的质谱图,并为产品质量属性提供特定领域的信息。由于G和GS连接子对常见蛋白酶的降解具有抗性,因此很难分离结构域以进行深入分析。因此,Genovis开发了GlySERIAS,不同于IdeS酶,一种消化柔性富含甘氨酸的连接子的酶。GlySERIAS可以分离不同的功能域,并实现对融合蛋白、多特异性抗体和含有富含甘氨酸的连接子的各种mAb片段进行详细表征的中级方法。瑞典生物技术公司Genovis提供IdeS蛋白酶等,用于mAb、ADC药物的开发、生产和质量控制。辽宁IgGZEROIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶

与IdeS不同,为了获得更均匀的度拉糖肽融合蛋白的消化产物,用Genovis的GlySERIAS固定化蛋白质消化该蛋白质,该蛋白由与琼脂糖珠共价偶联的GlySERIAS酶组成。通过将酶偶联到树脂上,可以增加酶与蛋白质的比率,从而可以进一步加速反应,以获得更完整的连接子消化。此外,该酶不会存在于样品制备中,可能会干扰样品分析。为了进行比较,度拉糖肽在37°C下用GlySERIAS固定化过夜,或用GlySERIAS冻干1小时并在37°C下过夜消化。 为了降低样品复杂性,使用内切糖苷酶GlycINATOR冻干去除Fc聚糖,并减少链间二硫键。通过反相LC-MS对样品的分析表明,GlySERIAS Immobilized几乎完全消化了Fc结构域中的连接子,留下了接近均质的Fc/2产物,其中含有来自连接子的一个丝氨酸残基。用 GlySERIAS 冻干 1 小时或过夜消化,两者都会产生几种 Fc 产物,并附着不同数量的丝氨酸和甘氨酸残基。GLP-1肽在所有三个样品中以两种变体存在。使用GlySERIAS固定化消化的均质Fc/2能够详细研究特定于Fc区域的质量属性。此外,在样品中未观察到干扰分析的酶峰。作为补充,Fc/2 产物在用 GlySERIAS 冻干消化后残留部分连接子,有助于研究位于 GS 连接子的修饰。云南FabDELLOIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶FabRICATOR (IdeS) 是一种 IgG 特异性半胱氨酸蛋白酶。

蛋白酶用于生成肽,用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影,传统的蛋白酶并不总是理想的,因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶,可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比,所得肽更长,并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物,使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性,即使在长时间孵育过夜后,酶与底物的比例也很高(1:5)。然而,ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性,但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1:20 和过夜孵育下,证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下,GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性,并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。
对于携带突变铰链的 Fc 融合蛋白或抗体来说,Fab 和 Fc 片段的生成可能具有挑战性。Genovis的GingisKHAN酶在铰链上方一个可触及的赖氨酸位点消化人IgG1,在足够温和的还原条件下保留链内和链间二硫键,从而产生完整的Fab和Fc片段。对于融合蛋白,消化通常在铰链上方获得,但融合伴侣的结构和氨基酸序列可能导致其他暴露的消化位点。如果去除保守的 Fc N-聚糖,Fc 中的第二个切割位点也可能被GingisKHAN酶切。将精选的单克隆人 IgG1 抗体和 Fc 融合蛋白与 GingisKHAN 在 37°C 下孵育 1 小时,并通过 HPLC 进行分析。Genovis的GingisREX (RgpB)可用于肽图分析、从头肽测序和翻译后修饰分析;产生更长的肽 - 提高序列覆盖率。

在Genovis,我们的策略是帮助客户进行中级(或亚基)分析,这是我们的工作,特别是我们的蛋白质酶切产品。完整质量和肽图谱是蛋白质表征的常用方法,我们发现,与简单但信息有限的完整质量和高度复杂但信息丰富的肽图谱相比,中级方法具有优势。通过执行中级描述,您可以生成从完整的质量实验中获得的所有信息,具有额外的优势。在对抗体进行完整质量分析时,很难明确地识别某些修饰。质谱仪器正在改进,可以更有效地分析更大的分子,但通过使用我们的SmartEnzymes,如IdeS,可以将抗体分解成更小的片段,这提高了这些实验可以执行的分辨率,因此,增加了鉴定修饰的信心。此外,你不仅能够更好地识别修改,而且你能够将它们定位到蛋白质上的单个结构域,这是你在完整水平上无法做到的。Genovis提供具有低水平内du素的FabRICATOR (IdeS)冻干。山西FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学
如Thermo Scientific™ KingFisher™ ;在振动台上也能同样出色地工作。辽宁IgGZEROIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
Genovis的FabRICATOR Fab2 (IdeS)试剂盒可消化兔 IgG,但要在亲和步骤中捕获 Fc 片段,您需要另一种填料,而不是试剂盒中通常包含的 CaptureSelect™ Fc。如果您对处理兔IgG感兴趣,请联系Genovis团队,我们将在FabRICATOR Fab2试剂盒中提供与兔Fc相容的树脂色谱柱。使用FabRICATOR的抗体消化的简单性、速度和可重复性也意味着这种酶可以被用于质量控制应用。 QC方法需要执行简单,易于训练,高度可重复,数据易于分析,这正是您使用FabRICATOR所得到的。 因为它适用于一系列不同的IgG,这也意味着使用FabRICATOR进行QC工作的客户将能够在未来的产品中使用它。 这显示了这种酶在抗体消化中是多么的有效。辽宁IgGZEROIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
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