湖南FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学

Genovis的FabRICATOR MagIC自动样品制备可用于分析和监测不同的CQA。mAb在生产或储存过程中的氧化就是这样一种CQA，可能会影响zhiliao产品的质量。为了展示FabRICATOR MagIC如何解决这个问题，对6种mAb的混合物进行强制降解（室温下3个月），并通过反相LC-MS进行分析。当在完整水平上分析mAb时，可以检测到mAb5丰度的显着差异，同时出现许多新的峰。然而，无法获得可靠的质量数据。使用FabRICATOR MagIC，mAb5变化的来源在Fab区域内。随后还原为 Fc/2、LC 和 Fd' 片段，可以识别差异是由于 mAb5 Fd' 片段上的色氨酸氧化，通过形成氧代内酯 （+14 Da） 和二氧代内酯 （+30 Da） 以及 mAb5 LC （-18 Da） 的琥珀酰亚胺化来揭示。此外，还可检测到mAb3轻链的异构化。该示例说明了FabRICATOR MagIC在mAb中级分析中的强大功能，它创建的片段足够小，可以精确定位特定的修饰，而无需耗时耗费资源的肽图分析，所有这些都以相对较少的手动操作时间快速完成。为了分别研究度拉糖肽的肽和 Fc 区域，用GlySERIAS 在 37°C 下冻干消化1 小时。湖南FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学

Genovis的FabDELLO在铰链上方的单个位点消化人IgG1，并在两小时内生成均质的Fab和Fc片段（Genovis的IdeS在铰链区下方的单个位点进行消化）。生成的片段可用于结晶和高阶结构（HOS）的NMR研究、结合研究等。突变的铰链区域是zhiliao性候选抗体的常见修饰，以降低效应器功能。这些突变可能会影响具有高底物特异性的酶的抗体消化效率。例如，高度特异性的FabRICATOR（IdeS）消化效率对含有常见LALA突变的抗体产生负面影响。FabDELLO作用于人IgG1铰链上方的单个暴露赖氨酸残基，能够对具有突变铰链区域的抗体进行流行的中级LC-MS分析。例如，用FabDELLO消化市售的IgG1risankizumab，在下铰链区域具有LALA突变，并通过反相LC-MS进行分析。消化产生均匀的Fab和Fc片段。用20mMDTT还原片段，用于中级LC-MS分析，发现产生了均相的Fc/2、轻链（LC）和Fd片段。用FabDELLO消化后观察到的定义峰显示出均匀的片段生成和酶的稳健性能。黑龙江FabRICATOR ZIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶有效消化，适用于灵敏的体内或基于细胞的检测。

对于涉及完整Fab或Fc抗体片段的应用，需要在抗体铰链处进行消化。木瓜蛋白酶和 Lys-C 等传统酶可用于生成 Fab 片段，但非特异性酶活性需要仔细优化，以极大限度地降低多个消化位点的风险。Genovis的SmartEnzymes IgG 蛋白酶 GingisKHAN 和 FabALACTICA 具有一个消化位点，可从人 IgG1 生成均质的 Fab 和 Fc 抗体片段。生成的片段可用于结晶和高阶结构 （HOS） 的 NMR 研究、结合研究等。在这里，我们提出了获得完整Fab和Fc抗体片段的不同策略。所得片段显示 GingisKHAN 的有效消化，用于生成完整的 Fab 片段或从依那西普上的融合 TNFR 结构域中分离 Fc。由于 GingisKHAN 的特异性消化依赖于 IgG 的天然折叠，因此在变性条件下特异性受到负面影响。为了使用SDS-PAGE分析消解效率，在加入SDS上样缓冲液之前，停止在分析样品中加入碘乙酰胺的反应。Genovis同时提供IdeS酶的纯化试剂盒。

抗体 Fc 糖基化谱是一种重要的 CQA，因为它会影响疗效、和免疫原性。因此，需要从早期开发、工艺开发到质量控制和批量放行的整个过程对Fc聚糖谱进行监测。传统的分析方法基于对游离的聚糖进行荧光标记，然后通过HILIC-HPLC或CE进行分析，这需要多步骤的样品制备方案，这需要大量的时间和资源。使用Genovis的FabRICATOR MagIC酶解mAb，然后使用LC-MS进行中级分析，为Fc聚糖分析提供了一种快速、直接的替代方法。如上所示，它很容易实现自动化，以提高通量并降低处理错误的风险。获得完整Fab和Fc抗体片段，用于结晶和高阶结构 （HOS） 的 NMR 研究、结合研究等。

与IdeS不同，Genovis的GlySERIAS是一种独特的酶，可消化柔性富含甘氨酸的融合蛋白连接子，例如Gly4Ser和GlyxSery（GS）以及聚甘氨酸（G）接头。该酶能够分离多功能融合蛋白的各个结构域，以促进表征并增加对这些分子的理解。融合蛋白的中级分析既可以降低整体样品的复杂性，又可以对翻译后修饰进行结构域特异性鉴定和监测。为了改善连接子的去除，Genovis建议使用GlySERIASImmobilized。对于连接子表征，我们推荐GlySERIAS冻干。具有柔性接头的独特酶消化融合蛋白；中级方法可降低融合蛋白表征的复杂性；复杂融合蛋白的可靠且可重复的消化。Genovis的GlySERIAS酶切由甘氨酸或甘氨酸和丝氨酸残基的重复序列组成的柔性连接子。该酶在天然反应条件下具有活性，能够对复杂的融合蛋白进行中级表征。连接子区域同时在多个位点被消化，导致先前连接的组分分离。活性发生在pH7.6下，孵育时间可以根据所需的产物而变化。GlySERIAS是从噬菌体K克隆而来的，在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签，分子量为18kDa。IgASAP Sub1+2 可消化分泌物和血清 IgA。河南GlySERIASIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶

Genovis的FabRICATOR （IdeS）HPLC酶色谱柱，可快速进行单克隆抗体的柱上酶切，并产生一致的亚基。湖南FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学

蛋白酶用于生成肽，用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影，传统的蛋白酶并不总是理想的，因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶，可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比，所得肽更长，并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物，使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性，即使在长时间孵育过夜后，酶与底物的比例也很高（1：5）。然而，ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性，但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1：20 和过夜孵育下，证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下，GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性，并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。湖南FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学