藪内氏黄杆菌

在海洋石油污染的修复现场，一种革兰氏阴性细菌正发挥着关键作用——亚德食烷菌（Alcanivorax jadensis），又称亚德食烷细菌。这名字中的"亚德"二字，源于其发现地德国亚德湾（Jade Bay），而"食烷"则精细描述了其以烷烃为食的专性代谢特性，是食烷菌属（Alcanivorax）的模式种之一，也是海洋石油生物降解的"急先锋"。 亚德食烷菌隶属于细菌域、变形菌门（Proteobacteria）、γ-变形菌纲、假单胞菌目、海杆菌科（Marinobacteraceae）。该菌于2000年由德国微生物学家Bruns和Berthe-Corti从亚德湾海水中分离鉴定，模式菌株为T9（= DSM 12178 = CIP 107620），16S rRNA基因序列登录号为AJ001150。作为模式菌株（type strain），它是食烷菌属分类界定和系统发育研究的基准材料。 在形态特征上，亚德食烷菌为革兰氏阴性杆菌，细胞呈杆状，不产芽孢，好氧。在M2平板上25℃生长6天时，菌落呈乳黄色微红色，凸起，湿润光滑，半透明，边缘无晕，直径0.5-1毫米。其更适生长温度为25-30℃，生长需要海水盐度（NaCl 1-15%，更适3-7.5%），严格好氧。接触酶和氧化酶均为阳性，这些特征使其能够在海洋环境中高效获取能量。 该菌更引人注目的特性是其专性烷烃降解能力。从茶园到玉米地，再到防蚊孑孓的水塘，Bt用显微镜下的臂膀，为人类守住绿色丰收与清洁水源 。藪内氏黄杆菌

在温带森林的榆树倒木上，一种形态优雅、生态功能独特的菌悄然生长——分枝榆孔菌（Polyporus ciliatus），又称纤毛多孔菌。这名字中的"分枝"二字，源于其子实体菌柄多次分枝的特征，而"榆孔"则精细指向了它对榆属（Ulmus）等阔叶树的生态偏好，是森林生态系统中重要的木腐菌。 分枝榆孔菌隶属于担子菌门、多孔菌目、多孔菌科，是一种典型的一年生革质菌。其子实体中等大小，菌盖圆形，直径2-7厘米，中部常具脐状凹陷，新鲜时呈革质，干燥后变得坚硬耐久。菌盖表面平滑或具细微皱纹，颜色从棕色至深棕色不等，边缘常具醒目的长形纤毛，干燥时向内卷曲，这一特征成为其重要的识别标志。菌柄圆柱形，基部稍宽，长1.5-6厘米，与菌盖同色或较浅，常从共同基部多次分枝，每个分枝顶端承载一个菌盖，形成独特的簇生形态。 该菌的产孢结构精致而规律。菌管短而细密，孔口圆形，干燥时呈角状，每毫米5-7个，管长可达2毫米。菌肉质地均匀，白色至奶油色，厚达2毫米，与菌管由一条较深的线分隔。菌丝系统为二型菌丝：生殖菌丝薄壁至略厚，具锁状联合；骨架结合菌丝厚壁，中等分枝，赋予子实体坚韧的质地。沙漠类诺卡氏菌因其安全无残留，我国年产量已达3.5万吨，覆盖333万公顷农田，成为用量大的微生物杀虫剂 。

刺状鞘氨醇单胞菌（Sphingomonas paucimobilis）是一类革兰氏阴性的杆状细菌，属于鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas）。该菌以其独特的细胞膜结构、广的污染物降解能力和在环境生物技术中的重要应用而著称，是研究微生物降解机制和开发生物修复技术的模式菌株。分类地位与形态特征刺状鞘氨醇单胞菌呈直杆状或略弯曲，大小约为0.3-0.5×1.0-2.0 μm，无芽孢，具单根或数根极生鞭毛，运动活跃。其更明显的细胞特征是含有糖鞘脂（GSL）而非典型的脂多糖（LPS）作为细胞膜外膜的主要成分，这种独特的膜结构赋予其对疏水性化合物的高度亲和力和耐受性。菌落形态为圆形、光滑、边缘整齐，呈淡黄色至橙黄色素产生与类胡萝卜素积累有关。该菌为严格好氧的化能异养菌，更适生长温度为25-30℃，更适pH为6.5-7.5。污染物降解机制刺状鞘氨醇单胞菌是广谱性污染物降解菌，能够代谢多种难降解有机化合物，包括多环芳烃（PAHs）、杂环化合物、农药和合成染料等。其降解能力源于独特的膜转运系统和多功能氧化酶系：糖鞘脂膜结构促进疏水性底物的跨膜运输。

索诺拉沙漠芽孢杆菌（Bacillus sonorensis）是一类从北美洲索诺拉沙漠（Sonoran Desert）极端环境中分离获得的革兰氏阳性细菌，属于芽孢杆菌属（Bacillus）。该菌以其对高温、干旱、高紫外辐射等多重极端胁迫的适应能力而著称，是研究微生物抗逆机制和开发生物技术应用的宝贵资源。分类地位与形态特征索诺拉沙漠芽孢杆菌呈直杆状，大小约为0.5-1.2×2.5-10.0 μm，具周生鞭毛，运动活跃。作为典型的芽孢杆菌，其更明显的形态特征是能够形成椭圆形端生芽孢，芽孢具有极强的抗逆性，可在营养匮乏或环境恶劣时长期存活。菌落形态多为圆形、边缘不规则、表面干燥皱褶，呈乳白色至淡黄色。该菌为兼性厌氧菌，更适生长温度为35-45℃，可在10-50℃范围内生长，属于嗜温偏热型微生物。极端环境适应机制索诺拉沙漠是北美洲更热、更干旱的沙漠之一，昼夜温差极大，紫外辐射强烈。索诺拉沙漠芽孢杆菌进化出了多重抗逆适应策略：其细胞壁含有大量吡啶二羧酸钙和小的酸性可溶性蛋白，赋予芽孢对热、辐射和干燥的极强抗性；细胞膜脂肪酸组成以分支链iso-和anteiso-脂肪酸为主，维持高温下的膜流动性；胞内积累海藻糖、脯氨酸等相容性溶质，抵御渗透胁迫。这些菌丝环通常由3个细胞组成，内含特殊的"密集体"细胞器，表面覆盖粘性物质。

高加索异常倚囊霉（Pilaira caucasica）是接合菌门毛霉目倚囊霉科的一种粪生菌，由Milko于1970年首先描述发表，后由我国菌学家郑儒永和刘晓勇（2009）将其重新归类为异常倚囊霉的高加索变种（Pilaira moreaui var. caucasica）。这一分类调整基于形态学差异与分子系统学的综合证据，体现了现代菌分类学从形态向多相分类的转变。形态上，高加索异常倚囊霉具有倚囊霉属的典型特征。其菌落呈白色、疏松的棉絮状，在PDA培养基上28℃培养时扩展迅速。更明显的特征是其孢子囊结构：孢子囊梗直立，具强烈的趋光性（光向性），几乎不分枝，直接从基质生出，末端不具肿胀结构，基部无营养囊。孢子囊顶生，呈半球形，具囊轴，壁厚且角质化，成熟时不破裂而是沿基部缝合线整体脱落，孢子呈深褐色。与指名变种相比，高加索变种的孢子囊柄和孢子大小存在细微但稳定的差异。生态习性方面，高加索异常倚囊霉是典型的粪生菌，常生于草原草食动物或啮齿类动物的粪便上，在森林生态系统的物质循环中扮演重要分解者角色。其分布与高加索地区及中国西部草原的生态环境密切相关。在生物技术应用方面，作为Pilobolaceae科成员，高加索异常倚囊霉与同属其他种一样，具有潜在的光生物学研究价值。同时释放挥发性 2,3-丁二醇，启动植物 ISR 信号，使叶片过氧化物酶活性提高 1.8 倍，达到“未病先防”。香蕉生假丝酵母

当感知到线虫存在时，菌丝会特化形成三维黏性网——由黏性的 loops 和分枝构成的不规则网状结构。藪内氏黄杆菌

刺柄犁头霉原变种（Absidia spinosa var. spinosa）是接合菌门毛霉目毛霉科犁头霉属的模式菌株，由菌学家Lendner发表定名，是研究接合菌分类学和形态学的关键参照材料。该菌现保藏于中国科学院微生物研究所、荷兰CBS（原始编号CBS 106.08）及上海保藏中心（SHMCC D69423）等多个国际菌种保藏机构，为菌系统学研究提供了标准化资源。形态上，刺柄犁头霉原变种呈现典型的犁头霉属特征。其在综合PDA培养基上25℃培养时，形成白色、扩展旺盛的小型丝状菌落，气生菌丝繁茂呈棉絮状，培养基背面呈淡黄色并伴有皱褶。该菌更明显的鉴别特征是具有特殊的孢子囊结构：孢囊梗自匍匐于基质表面的匍匐丝（stolons）上生出，基部具分枝状的假根（rhizoids），与毛霉属明显不同。孢子囊呈洋梨形，具半球形或锥形囊轴，成熟后壁易破裂释放孢囊孢子。孢子囊壁破裂后残留的囊领（collar）呈刺状或齿状，这也是种加词"spinosa"（具刺的）的形态学依据。分类学上，刺柄犁头霉原变种是界定该种种内变异的重要基准。该种下还包含双附丝变种（var. biappendiculata）等分类单元，主要区别在于接合孢子形成时配囊柄上附属丝的有无和形态。藪内氏黄杆菌